WGS and Brucella data analysis

Il dott. Carlo Cossu, studente di dottorato dell’Università di Pretoria (Sudafrica), si è formato presso i laboratori dell’IZS di Teramo su “WGS and Brucella data analysis”, sotto la supervisione del dottor Giuliano Garofolo. La formazione, dal 30 novembre al 6 dicembre 2023, ha riguardato le analisi della sequenza dell'intero genoma di ceppi di Brucella isolati da animali selvatici.

Nello specifico il training formativo ha affrontato tematiche legate alla diagnosi della brucellosi, con particolare attenzione sulle peculiarità riscontrate nelle specie selvatiche. Inoltre sono state esaminate le avanzate tecniche di identificazione molecolare e il sequenziamento Whole Genome Sequencing (WGS), insieme all’applicazione di analisi bioinformatiche per la valutazione dei cluster.

Nel periodo di permanenza a Teramo il dott.Cossu ha frequentato i reparti Batteriologia e Igiene produzioni lattiero-casearie, Biologia Molecolare e Tecnologie Omiche e Bioinformatica.

Le attività svolte sono il frutto della collaborazione tra il Centro di Referenza Nazionale e il Laboratorio di Referenza WOAH per le brucellosi dell’IZS di Teramo, il network ERFAN e l’Università di Pretoria: una collaborazione che mira a sostenere la ricerca di rilevanza internazionale sulla brucellosi, compresa la ricerca sulla presenza di Brucella nelle specie selvatiche africane.