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ISSUES ONLINE
2019 - Volume 55 (1), January-March |
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Chahinez Messaili, Yamina Messai, Rabah Bakour |
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Virulence gene profiles, antimicrobial resistance and phylogenetic groups of fecal Escherichia coli strains isolated from broiler chickens in Algeria |
35-46 |
doi: 10.12834/VetIt.799.3865.2
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Summary
The objective of the study was to determine the virulence and antimicrobial resistance traits of 100 fecal E. coli strains isolated from clinically healthy chickens in Algeria. Most of isolates belonged to phylogroups A (45%) and B1 (37%) and showed a great diversity in DNA profiles. The genes fimH, tsh, entB, iutA, irp2, fyuA, iroN, sitA, etsA, etsB, eitA, iss, traT, ompT, hlyF, vat, ibeA, cvaA, cvaB5’, cvaB3’, cvaC, cma and cbi were detected. Combinations of virulence genes defined 67 virulence profiles. High resistance rates (62-97%) were noted for amoxicillin, amoxicillin-clavulanic acid, cefazolin, fluoroquinolones, tetracycline, trimethoprim, sulfonamides and sulfamethoxazole/trimethoprim, and 93% of strains were multidrug-resistant. Combinations of resistance phenotypes defined 59 resistance patterns. The genes blaTEM, blaSHV, blaCTX-M-1, tetA, tetB, qnrB, qnrS1, sul1, sul2, sul3, dfrA1, dfrA7, dfrA12 and dfrA14 were identified and class 1 integrons were detected in 49% of isolates. A rate of 37% of strains was resistant to mercury, with the presence of merA gene. The study reports the presence in the avian strains isolated from fecal swabs of virulence genes of plasmid origin characteristic of ExPEC strains associated with high resistance to first-line antibiotics and class 1 integrons, this augurs a risk for human and animal health.
Keywords
Avian fecal E. coli, Broiler chickens, Phylogenetic groups, Virulence, Antimicrobial resistance. |
Full text |
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Geni di virulenza, resistenza antimicrobica e correlazione filogenetica di ceppi di
E. coli isolati da allevamenti di broiler in Algeria
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Riassunto
L'obiettivo dello studio è stato quello di determinare i caratteri di virulenza e di resistenza antimicrobica di 100 ceppi di E. coli fecali isolati da polli clinicamente sani in Algeria. La maggior parte degli isolati apparteneva ai filogruppi A (45%) e B1 (37%) e mostrava una grande diversità nei profili genetici. Sono stati rilevati i geni fimH, tsh, entB, iutA, irp2, fyuA, iroN, sitA, etsA, etsB, eitA, iss, traT, ompT, hlyF, vat, ibeA, cvaA, cvaB5’, cvaB3’, cvaC, cma e cbi. Le combinazioni tra i geni di virulenza hanno permesso di definire 67 profili di virulenza. Sono stati rilevati alti tassi di resistenza (62-97%) per amoxicillina, amoxicillina-acido clavulanico, cefazolina, fluorochinoloni, tetraciclina, trimetoprim, sulfonamidi e sulfametossazolo/trimetoprim e il 93% dei ceppi presentavano resistenza multipla. Sono stati identificati i geni blaTEM, blaSHV, blaCTX-M-1, tetA, tetB, qnrB, qnrS1, sul1, sul2, sul3, dfrA1, dfrA7, dfrA12 e dfrA14; gli integroni di classe 1 sono stati rilevati nel 49% degli isolati. Una percentuale del 37% dei ceppi era resistente al mercurio, con la presenza del gene merA. Lo studio riporta la presenza, nei ceppi aviari isolati da tamponi fecali, di geni di virulenza di origine plasmidica caratteristici dei ceppi ExPEC associata ad un’elevata resistenza agli antibiotici di prima linea e di integroni di classe 1: un rischio per la salute umana e animale.
Parole chiave
E. coli fecale aviare, Gruppi filogenetici, Polli, Resistenza antimicrobica, Virulenza. |
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