Riassunto
In questo studio è stato effettuato il sequenziamento completo della regione proteinasi leader (Lpro) di 21 ceppi del virus dell'afta epizootica, sierotipo O, isolati in India nel corso di diversi focolai. Le sequenze nucleotidiche della regione Lpro sono state confrontate con le sequenze omologhe dei ceppi vaccinali. L'analisi filogenetica condotta sulle sequenze Lpro ha rivelato una differente distribuzione dei ceppi nei cluster rispetto a quella ottenuta dall'analisi della sequenza nucleotidica codificante la proteina del capside VP1. Il confronto fra le sequenze amminoacidiche della porzione N terminale della regione Lpro ha mostrato un'elevata variabilità con la sola presenza di due codoni AUG conservati in posizione 1 e 29. È importante notare che tutti i residui amminoacidici che formano il sito attivo di taglio delle sequenze Lpro analizzate in questo studio risultano conservati. I risultati ottenuti suggeriscono che la sequenza Lpro potrebbe essere utilizzata per effettuare studi filogenetici sugli isolati del virus dell'Afta epizootica.
Parole chiave
Analisi filogenetica,
Regione proteinasi leader (Lpro),
Sierotipo O,
Virus dell'afta epizootica. |