Riassunto
Ceppi del virus della diarrea virale bovina 2 (BVDV-2) isolati in bovini, pecore e contaminanti avventizi di prodotti biologici sono stati valutati con il metodo delle sostituzioni nucleotidiche palindromiche (PNS) a livello dei tre siti variabili (V1, V2 e V3) nella regione non tradotta (UTR) 5', per determinare il loro stato tassonomico. Le variazioni in sequenze genomiche conservate sono state usate come parametro per la valutazione epidemiologica della specie sulla distribuzione geografica, animali ospiti e virulenza. Quattro genotipi sono stati identificati nella specie. La segregazione tassonomica ha corrisposto alla distribuzione geografica delle varianti dei genotipi. Il genotipo 2a ha mostrato una distribuzione cosmopolita ed era l'unico genotipo responsabile di infezione sia in pecore che bovini. I genotipi 2b, 2c e 2d erano limitati al Sud America. I genotipi 2a e 2d erano correlati alla contaminazione di prodotti biologici. La variazione genetica ha potuto essere correlata alla diffusione delle varianti della specie BVDV-2 in differenti aree geografiche. Cronologicamente, la specie è emersa in Nord America nel 1978 e si è diffusa nel Regno Unito e Giappone, Europa continentale, Sud America e Nuova Zelanda. Correlazioni tra quadri clinici riferiti ad isolamento di ceppi di BVDV-2 e variazioni genetiche hanno indicato che il sottogenotipo 1, variante 4 del genotipo 2a, era in relazione ad una sindrome emorragica. Queste osservazioni suggeriscono che la valutazione della struttura genomica secondaria, identificando marcatori di espressione di attività biologiche virali e di storia evolutiva della specie, potrebbe essere applicata come utile mezzo per la valutazione epidemiologica della specie BVDV-2 e possibilmente per altre specie del genere Pestivirus.