Nel quadro generale dei rapporti tra il Ministero della Salute italiano e i maggiori Organismi internazionali (WOAH, FAO, UE), l’IZS dell'Abruzzo e del Molise è coinvolto nella realizzazione di progetti nel settore veterinario e della sicurezza degli alimenti.
L’azione congiunta e i progetti di collaborazione con numerosi Organismi internazionali hanno fatto guadagnare all’Istituto prestigiosi riconoscimenti, alimentando il clima di fiducia verso le iniziative intraprese. L’IZS dell'Abruzzo e del Molise svolge attività di cooperazione scientifica mediante la partecipazione ai Programmi comunitari e ai Programmi, operativi e mirati, definiti dalla FAO e dalla WOAH.