e-ISSN 1828-1427 |
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Rivista trimestrale di Sanità
Pubblica Veterinaria edita dall'Istituto Zooprofilattico Sperimentale
dell'Abruzzo e del Molise G. Caporale
A quarterly journal devoted to veterinary public health, veterinary science and medicine published by the Istituto Zooprofilattico Sperimentale dell’Abruzzo e del Molise ‘G. Caporale’ in Teramo, Italy |
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ISSUES ONLINE
2019 - Volume 55 (3), July-September |
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Luca Tassoni, Gianpiero Zamperin, Eliana Schiavon, Vera Vendramin, Lara Cavicchio, Monica Mion, Francesco Tonon, Isabella Monne, Maria Serena Beato |
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First whole genome characterization of porcine astrovirus detected in swine faeces in Italy |
221-229 |
doi: 10.12834/VetIt.1873.9956.1
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Summary
Porcine astroviruses (PoAstV) are found in the gastrointestinal tract of healthy and diseased pigs worldwide. However, their role in causing enteric disease in pigs and other animals has not been elucidated. In the present report, we describe for the first time in Italy, the identification and genetic characterization, through whole genome sequencing, of a PoAstV2 in pigs in Northeast Italy in 2015. This instance is the first detection of PoAstV2 in pigs in Italy. The phylogenetic analysis of the complete ORF2 segment highlights the high similarity of this virus to those circulating that same year in Japan. There are very few full astrovirus genomes available, and the present data represent an important contribution towards a better understanding of the characteristics and evolution of these viruses.
Keywords
Porcine astroviruses,
Metagenomics,
Whole genome. |
Full text |
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Prima caratterizzazione dell’intero genoma di porcine astrovirus individuato nelle feci di un suino in Italia |
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Riassunto
Gli astrovirus sono virus identificati nel tratto gastrointestinale dei suini con e senza manifestazioni cliniche. La loro presenza nella popolazione suina è segnalata a livello globale. Il loro ruolo come agenti causali di patologia gastroenterica è tuttora poco chiaro. Nel presente lavoro si descrive, per la prima volta in Italia, l’identificazione e la caratterizzazione genetica, attraverso sequenziamento dell’intero genoma, di un Porcine Astrovirus tipo 2 (PoAstV2) in Veneto nel 2015. L’analisi filogenetica dell’ORF2 evidenzia una alta similarità del virus con altri PoAstV circolanti lo stesso anno in Giappone. Poche sono le sequenze complete di astrovirus, e il presente dato rappresenta un importante contributo verso una migliore comprensione delle caratteristiche dei PoAstV.
Parole chiave
Astrovirus suino,
Metagenomica,
Intero genoma. |
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