Riassunto
Nel presente lavoro è stato determinato il profilo dei geni di virulenza di 26 ceppi enteropatogeni di Escherichia coli con la tecnica del DNA microarray; i campioni sono stati prelevati da 17 focolai di colibacillosi rilevati in conigli provenienti da due regioni del Nord Italia. I ceppi sono stati classificati secondo il loro biotipo, il sierogruppo e il gruppo filogenetico. È stata anche precisata la distribuzione dei geni di virulenza che codificano il Locus di cancellazione degli enterociti (LEE), il quello del sistema di secrezione tipo 3 (T3SS), le proteine non-LEE traslocate tramite il T3SS e i fattori di adesione. I ceppi testati, ad eccezione di 1, appartengono ai gruppi filogenetici A e B1. È stata osservata, inoltre, un’associazione predominante tra il sierogruppo O103 e il fenotipo ramnosio-negativo (biotipi 12 o 14). Il profilo del LEE maggiormente riscontrato è stato ler/cesT/espA-1/espB-3/tir-1/eae(beta)/espD-2/escN/eprJ. Tutti i ceppi possedevano il fattore di adesione rabbit-2 (afr/2) o il ral (Rabbit Adherence Locus) e 24 di essi un ulteriore set costituito da uno o più tra i fattori di colonizzazione efa1/lifA, lpfA e paa. Infine, la presenza singola o combinata di proteine effettrici LEE e/o non-LEE, che codificano i geni espG, cif, map e nle, ha attestato la potenzialità genetica che hanno i ceppi studiati ad indurre lesioni patologiche all'ospite. Le tecnologie basate sul microarray, applicate alla valutazione del profilo genetico dell’Escherichia coli del coniglio, si sono dimostrate convenienti e affidabili se finalizzate ad indagini a larga scala all’interno di programmi di sorveglianza per monitorare la circolazione di ceppi patogeni nella filiera di produzione del coniglio, valutare il loro potenziale genetico zoonotico, e selezionare ceppi patogeni di E. coli per creare una profilassi vaccinale mirata nelle unità da ingrasso degli allevamenti cunicoli.