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e-ISSN 1828-1427

  

Rivista trimestrale di Sanità Pubblica Veterinaria edita dall'Istituto Zooprofilattico Sperimentale dell'Abruzzo e del Molise ‘G. Caporale’

A quarterly journal devoted to veterinary public health, veterinary science and medicine published by the Istituto Zooprofilattico Sperimentale dell’Abruzzo e del Molise ‘G. Caporale’ in Teramo, Italy

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2018 - Volume 54 (2), April-June
   
 
Barbara Cioffi, Maria Grazia Amoroso, Vincenzo Pasquale, Giorgio Galiero and Giovanna Fusco  
Comparison of automated extraction methods for the detection of hepatitis A virus and norovirus in mussels 147-153
doi: 10.12834/VetIt.1133.6147.3
 

Summary
Noroviruses and hepatitis A virus are the pathogens most frequently involved in non-bacterial gastroenteritis and hepatitis worldwide. They are mainly transmitted via the faecal–oral route, direct person-to-person contact or through the consumption of contaminated water and foods. In food virology, detection methods of these viruses are currently based on real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). A crucial step in this process is the acid nucleic extraction, since its performance can negatively influence viral detection and thus give false negative results. The aim of this study is to evaluate the efficiency of 2 automated extraction systems, MagMAX Express and EZ1 Advanced XL, in recovering hepatitis A virus and norovirus RNA from mussels. In the present study, we used mengovirus as a process control to assess the efficiency of the extraction process. Samples were tested for mengovirus, hepatitis A, and norovirus by real time one-step RT-PCR assay. Our data indicates the MagMax Express is the better system to extract hepatitis A and norovirus RNA from mussels since its extraction efficiency was higher (p < 0.05) than EZ1 Advanced XL.

Keywords
Bivalves, Hepatitis A virus, Mengovirus, Mussels, Norovirus, Real‑time RT‑PCR.


Full text

      
 
Confronto tra metodi di estrazione automatizzata per l'individuazione del virus dell'epatite A e del norovirus nelle cozze
 
Riassunto
Il norovirus e l’epatite A sono i virus che più frequentemente causano in tutto il mondo le gastroenteriti non batteriche e le epatiti. Si trasmettono principalmente attraverso la via oro-fecale, il contatto diretto tra persone o consumando acqua e alimenti contaminati. Per rilevare la presenza di questi virus si utilizza una real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). In questo processo, l'estrazione dell’acido nucleico è un passaggio cruciale perché può influenzare negativamente la rilevazione virale, dando false negatività. Lo scopo di questo studio è valutare l'efficienza di 2 sistemi di estrazione automatizzata, MagMAX Express ed EZ1 Advanced XL, per rilevare nelle cozze la presenza dell’RNA del virus dell'epatite A e del norovirus. I campioni sono stati testati con real time one-step RT-PCR per epatite A, norovirus e mengovirus, utilizzando quest’ultimo come controllo per valutare l'efficienza del processo di estrazione. I dati hanno dimostrato che il MagMax Express è il sistema migliore, poiché raggiunge un'efficienza di estrazione più elevata (p < 0,05) rispetto a EZ1 Advanced XL.

Parole chiave
Bivalvi, Epatite A, Mengovirus, Cozze, Norovirus, Real‑time RT‑PCR.
 
 
    © Istituto Zooprofilattico Sperimentale dell'Abruzzo e del Molise 2018