L'attività formativa internazionale è finalizzata soprattutto alla crescita scientifica, tecnologica e manageriale dei servizi sanitari nei Paesi in via di sviluppo. In tal senso l'Istituto lavora da tempo a fianco dell'Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS), della Food and Agricolture Organisation of the United Nations (FAO), dell'Organizzazione Mondiale della Sanità Animale (OIE), ma anche di diversi Paesi che già fanno parte dell'Unione Europea.

Dal 2007 l'Istituto è tra i fornitori accreditati dalla Direzione Generale della Salute e della Tutela del consumatore (DG SANCO) della Commissione Europea per la realizzazione di corsi di formazione destinati ai veterinari dei Paesi europei, dei Paesi candidati a farne parte e dei Paesi terzi inclusi nel programma "Better training for safer food" su zoonosi e criteri microbiologici, benessere animale e buone pratiche per i controlli veterinari nei posti di ispezione frontaliera. Questo programma mira al miglioramento degli standard di sicurezza nel commercio internazionale al fine di assicurare alimenti sani ai cittadini europei.

Le attività di formazione internazionale sono tuttavia erogate anche a sostegno e supporto di iniziative più ampie che prevedono la costruzione di reti internazionali, quali ad esempio quelle per la sorveglianza delle malattie animali.