L'Istituto G. Caporale svolge attività di ricerca, sperimentazione, documentazione, formazione ed erogazione di servizi tecnologicamente avanzati. I suoi clienti tradizionali sono il Ministero del Lavoro, della Salute e delle Politiche Sociali , l'Istituto Superiore di Sanità, le Regioni Abruzzo e Molise, le Aziende Sanitarie Locali, ma anche gli allevatori, i produttori di alimenti di origine animale, i produttori di beni e servizi per la zootecnia e i consumatori.

I principali compiti dell'Istituto, definiti dal legislatore, sono la ricerca sperimentale sull'eziologia e la patogenesi delle malattie infettive e diffusive degli animali domestici e selvatici, l'igiene degli allevamenti e delle produzioni zootecniche; gli esami per la diagnosi di laboratorio delle malattie animali, per la sicurezza microbiologica e chimica degli alimenti di origine animale destinati all'alimentazione umana e dei mangimi zootecnici; la sorveglianza epidemiologica nell'ambito della sanità animale, dell'igiene delle produzioni zootecniche e degli alimenti di origine animale; la produzione di vaccini, reagenti e prodotti immunologici per la profilassi e la diagnosi delle malattie animali; la consulenza, l'assistenza e l'informazione sanitaria agli allevatori per la bonifica sanitaria e per lo sviluppo e il miglioramento igienico delle produzioni animali; la formazione e l'aggiornamento di veterinari e di altri operatori di sanità pubblica veterinaria.
Tutte le attività dell'Istituto, comprese quelle istituzionali, sono finalizzate ad un'innovazione continua che assume a suo fondamento il metodo sperimentale.