Da oltre tre decenni l'Istituto G. Caporale è protagonista sul piano nazionale ed internazionale attraverso progetti ed attività in aree di interesse cruciale nel campo della Sanità Pubblica Veterinaria.

In ambito nazionale l'Istituto partecipa ad innumerevoli progetti di Ricerca corrente e di Ricerca finalizzata, finanziati dal Ministero della Salute con il Fondo Sanitario Nazionale, per promuovere e finanziare una ricerca scientifica in campo biomedico e sanitario di elevata qualità e avere, così, una base scientifica per la programmazione di interventi mirati al miglioramento dello stato di salute della popolazione.

La ricerca corrente è l'attività di ricerca scientifica, a programmazione triennale, diretta a sviluppare nel tempo le conoscenze fondamentali in settori specifici della biomedicina e della sanità pubblica, nel cui ambito gli Enti sono riconosciuti quali Istituti di Ricovero e Cura a Carattere Scientifico (IRCCS). I finanziamenti per questo tipo di ricerca hanno cadenza annuale e sono erogati a favore dei soggetti istituzionali, pubblici e privati, la cui attività di ricerca è stata riconosciuta dallo Stato come orientata al perseguimento di fini pubblici.

Le attività di ricerca finalizzata, invece, attuano gli obiettivi prioritari, biomedici e sanitari, individuati dal Piano Sanitario Nazionale e sono svolte dalle Regioni, dall'Istituto Superiore di Sanità, dall'Istituto Superiore per la Prevenzione e la Sicurezza sul Lavoro, dalla Agenzia per i Servizi Sanitari Regionali, dagli Istituti di Ricovero e Cura a Carattere Scientifico e dagli Istituti Zooprofilattici Sperimentali.

Sempre in ambito nazionale l'Istituto partecipa in qualità di Ente Coordinatore ad un importante progetto per la realizzazione di un sistema di eLearning per l'Agricoltura nei paesi del Mediterraneo, finanziato dal Ministero dell'Università e della Ricerca Scientifica e Tecnologica (MURST) con stanziamenti del Fondo per gli Investimenti della Ricerca di Base (FIRB).